《表1 前30个差异表达基因的显著性情况》

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《骨关节炎相关基因差异的表达分析》

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开始使用affy包进行原始芯片归一化处理，然后通过R语言“limma”包的差异分析，GSE55235数据集共筛选出差异基因总数为756，其中包括467个上调基因和289个下调基因。GSE55457数据集共筛选出240个差异基因，其中上调基因56个，下调基因184个。将两个数据集中得到的上调和下调的基因分别取交集，共得到共同上调基因20个，共同下调基因36个。基于共有的56个差异基因，表1中显示了前30个差异表达基因的表达情况，这些差异基因是以adjusted P<0.05和|logFC|>1为标准筛选的。利用R语言中的“pheatmap”包绘制GSE55235和GSE55457基因热图（图1～图2）。