《表1 本研究鉴定帕博利珠单抗抗原表位与已报道的抗原表位对比》

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《鉴定单克隆抗体识别蛋白质抗原表位方法的建立》

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为了验证本研究抗原表位作图结果的准确性，在帕博利珠单抗和PD-1蛋白复合物晶体结构（PDB蛋白数据库：5GGS）上进一步分析了帕博利珠单抗与抗原表位氨基酸的相互作用（图7），结果显示PD-1抗原表位（黄色标记的氨基酸）通过形成氢键和范德华力等方式与帕博利珠单抗重链可变区CDR1的Y33、Y35，CDR2的N52、N55，CDR3的R99、Y101、R102、F103以及轻链可变区CDR1的S32、Y34、Y36，CDR2的Y53、Y57，CDR3的L98相互作用，该结果完全涵盖在Lee等[7]报道的帕博利珠单抗和PD-1蛋白相互作用的氨基酸中。将本研究鉴定出的抗原表位与已经报道的基于晶体结构解析的抗原表位进行对比，发现不同机构对帕博利珠单抗和PD-1蛋白复合物结晶解析出的抗原表位[7–11]略有差异，本研究鉴定出的抗原表位与已报道晶体结构解析的抗原表位高度一致（表1）。