《表1 基于单细胞技术定义的巨噬细胞亚群》
目前常用的单细胞技术主要是质谱流式技术(mass cytometry by time-of-flight,Cy TOF)和单细胞RNA测序(single-cell m RNA sequencing,sc RNA-seq),见图1。Cy TOF可同时检测数百万单个细胞中的40多个蛋白标记物,既类似于低维流式细胞仪的经典分析方法,也类似于单细胞测序的高维方法,对于理解TME复杂性有帮助[5]。sc RNA-seq则提供无偏见的策略来描述单个细胞的转录组特征,基于不同平台可有很多方法可供选择,比如使用全长测序方法(如Smart-seq2)高敏感度可检测到更多的基因数或3'端测序方法(如CEL-Seq2和MARS-seq)更少的放大噪音量化了m RNA水平,以及基于drop的方法(如Drop-seq、In Drop和10×Chromium Genomics)[6-7]增加测序通量。单细胞测序技术已应用于胚胎发育、神经生物学、肿瘤、免疫、微生物、嵌合体分析等多个研究领域[8-9],以及在多组学上探究单个肿瘤细胞的异质性和基因突变,还可用于临床中肿瘤耐药机制的研究,深入理解肿瘤发生、发展的过程[10]。目前利用单细胞技术探究巨噬细胞及其亚群标记物的文献总结见表1。
图表编号 | XD00210762900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.02.10 |
作者 | 代艳、包梦颖、曾燕玉、刘云、叶雨 |
绘制单位 | 广西医科大学第二附属医院、广西基因组与个体化医学研究重点实验室、广西基因组与个体化医学研究重点实验室、广西基因组与个体化医学研究重点实验室、广西医科大学第一附属医院骨科、广西医科大学第二附属医院 |
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