《表3 本研究使用毒株NGS测序数据统计》

《表3 本研究使用毒株NGS测序数据统计》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《通过全长cDNA扩增及高通量测序技术获取呼肠孤病毒科病毒的全基因组序列》


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-:尚未公布病毒基因组序列;病毒种类及病毒属全称参见表1

对7种呼肠孤病毒科病毒的NGS测序结果显示,不同毒株全基因组PCR扩增产物测序产生的数据量在1.3~1.9 G,获取的原始reads数在393 577800~571 343 600;过滤除去低质量的reads,用于病毒基因组拼接的reads (Q>30)数量在293 016 800~423 210 600,98.34%~99.91%过滤后reads被用于病毒基因组de novo组装,每个碱基位点的测序深度在6 000~20 000次,组装获取的病毒基因组大小在18266~23 605 bp,基因组GC含量在39.29%~46.60%,不同病毒的基因组节段数目在10~12,节段大小在788 bp (Seg-12)~3 982 bp (Seg-1)(表1,表3)。