《表2 桃仁-红花有效化合物与作用靶蛋白的结合分数》

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《基于分子对接和网络药理学预测桃仁-红花对冠心病的作用效应》

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注:能与PTGS2靶蛋白结合的化合物有24个，表中仅列出其中5个

将化合物与对应靶点进行分子对接判断桃仁-红花进入机体后能否与靶蛋白稳定结合。Systems Dock服务器是应用Auto Dock Vina进行对接模拟，进而预测配体与蛋白质的结合性能，通过调整X-Y-Z坐标和网格大小以细化绑定的位置[13]，并经过高精度对接模拟和分子路径图来综合表征配体选择性，其对接结果的分数是实验解离/抑制常数值（PKD/PKI）的负对数，docking scores的值通常为0～10[14]，一般认为docking score值大于4.25表示对接分子与靶点之间有一定的结合活性，大于5.0表明对接分子与靶点之间有较好的结合活性，大于7.0则说明具有强烈的结合活性[15]，其中化合物beta-carotene（编号:MOL002773）无法与靶蛋白结合，FOD、JUN、BCL2L1、VEGFA和KCNH2的PDB结构没有原配体，其他27个化合物与靶蛋白均有良好的结合性，分数大于5分的有51个（总数53个），大于7分的有18个，IGEMDICK软件的分子对接结果是以能量的高低来判断化合物结合程度的，能量分值越低，化合物分子与受体结合的作用可能性越大，IGEMDICK对接结果表明对接分数均低于-60，通过以上两种分子对接方式得到桃仁-红花潜在治疗靶点与有效化合物的对接结果，结果表明桃仁-红花潜在治疗靶点与有效化合物具有较好的结合性。见表2。