《表1 多肽的最优化三维结构》

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《亲木质素多肽的设计及其与苯丙烷二聚体的分子对接》

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根据Awasthi等人的研究结果[13]，Tve和Ptr漆酶中总计有148个氨基酸能与2种木质素苯丙烷二聚体结构进行捆绑，对这些氨基酸进行统计得到直方图（图2），选取出现频率最高的11种氨基酸用于多肽设计。另外，分析Tve漆酶结构，可以得到5个与木质素结合频次最高的氨基酸片段，分别是FPLG、PNHT、NPSF、GAPH和IDFH。参考Watanabe等人的研究成果，本研究也将目标多肽设计成十二肽，每条肽链长度都含有12个氨基酸，并且保持每个片段的N端顺序不变，由此可以得到10条十二肽序列（见表1）。另外，选用Watanabe等人报道的十二肽HFPSPIFQRHSH（记为R1）、甘氨酸连接的十二肽二聚体（记为R2）以及Trichoderma reesei纤维素酶外切纤维素酶的CBM做对比研究。