《表2 数据质量评估情况汇总》
注:过滤数据:过滤得到的总reads数;GC:G+C的数量占总的碱基数量的百分比;Q20:测序错误率≤1%的碱基数目比例;Q30:测序错误率≤0.1%的碱基数目比例
在处理72 h后,获得这6个转录组数据集的表达谱,对原始数据进行组装优化后,共获得281 379个转录本,组装得到所有转录本的总碱基个数为238 525 112,共179 921个Unigene (取转录本簇中最长的转录本作为Unigene),长度分布为201~17 921 bp,平均长度847.7 bp,N50长度为1 319 bp (表2),各个样品的Q20均大于98%,Q30均大于94%,这些结果证实了测序数据的高质量和进一步分析的适用性。
图表编号 | XD00196513100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.11.25 |
作者 | 赵燕楠、周宏正、李婉娟、王浩、吕利群 |
绘制单位 | 上海海洋大学国家水生动物病原库、上海海洋大学国家水生动物病原库、上海海洋大学国家水生动物病原库、上海海洋大学国家水生动物病原库、上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室、上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心、上海海洋大学国家水生动物病原库、上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室、上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心 |
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