《表1 咖啡因分子的Autodock对接结果》

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《基于分子模拟探索咖啡渣提取物抗冻材料的工业应用》


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最大团簇打分函数前10名构象的结合自由能(Binding energy)和抑制常数(Inhibition constants,ki)的统计结果如表1所示,咖啡因分子排名第一的最优构象显示它与细菌蛋白的结合自由能为-4.30 kcal/mol,反应咖啡因分子对受体细菌蛋白的抑制强度的抑制常数为699.79?mol/L,说明咖啡因分子的抑制能力较强。同时观察咖啡因分子对接受体的前十个构象的对接信息可知,在最大簇的119个构象的结合自由能值都非常接近,显示出配体构象与受体细菌蛋白良好的结合持续性和常态性,说明此团簇构象结构较稳定,全部对蛋白活性表达出良好的抑制作用。