《表6 配合比设计:曲霉来源的α-L-鼠李糖苷酶结构特征规律分析》

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《曲霉来源的α-L-鼠李糖苷酶结构特征规律分析》


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结构叠合的分类结果显示(表6),这21个曲霉来源α-L-鼠李糖苷酶可分为两大类(图6),XP_681743.1、XP_664533.1、XP_660235.1、XP_026602402.1、XP_022403539.1、XP_659810.1、XP_001727134.1、XP_026602632.1、XP_026603987.1、XP_026628025.1、XP_748610.1、XP_749916.1、XP_001395635.2、XP_001398938.2、XP_002383141.1、XP_002385047.1与CCB96437.1共17条序列组成第一大类,每条序列都拥有一个(α/α)6桶状结构和桶底的一个β折叠结构这一基本结构,根据除基本结构外的β片层结构的数量,又可以将第一大类分为4个小类(图7),其中XP_664533.1与XP_660235.1组成无额外β片层的第一个小类;XP_022383582.1、XP_749916.1、XP_001395635.2、XP_001398938.2与XP_002383141.1共5条序列组成有1个额外β片层的第二小类;XP_659810.1、XP_001727134.1、XP_026603987.1、XP_026628025.1、XP_748610.1与XP_002385047.1共6条序列组成有2个额外β折叠的第三小类;XP_681743.1、XP_026602402.1、XP_026602632.1与CCB96437.1共4条序列组成有3个额外β折叠的第四小类,目前已报道的曲霉来源的晶体结构(PDB:6gsz)[8]就属于这一类;XP_022383582.1、XP_026602627.1、XP_025515427.1与XP_026603527.1共4条序列组成第二大类,与第一大类不同,第二大类4个序列都属于GH106家族,因此拥有GH106的基本结构(α/β)8结构和环绕在桶装结构域周围的β折叠结构[26]。第一大类与第二大类的分类结果与进化树分类相符,说明蛋白的进化规律会一定程度的体现在其三级结构上;第一大类的四个小类与进化树分类不符,说明β折叠结构的数量并不能反映曲霉来源α-L-鼠李糖苷酶的进化规律。