《表1 多种菌株的PPK1蛋白理化性质》

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《Acinetobacter tandoii SC36 ppk基因的克隆与表达》

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基因ppk1-44所编码的蛋白PPK1-44与Acinetobacter tandoii DSM 14970、Escherichia coli str.K-12substr.MG1655、Pseudomonas aeruginosa PAO1、Pseudomonas aeruginosa KT2440、Neisseria meningitidis MC58、Microcystis、Synechocystis、Streptomyces coelicolor A3 （2）的PPK1蛋白氨基酸序列相似性分别为97%、35%、60%、60%、52%、43%、43%、43%。以大肠杆菌PPK1蛋白（PDB:1xdp）结构为参照，通过同源建模预测PPK1-44蛋白的三级结构（图1A），该模型显示PPK1-44蛋白是由2个单体PPK1-44蛋白形成的二聚体结构，具有1个ATP及2个镁离子结合位点。CDD软件预测结果（图1C）表明PPK1-44蛋白具有1个保守的PPK C端结构域，推测其具有PPK1酶活性。根据利用MEGA 7构建的系统发育树（图1B）表明Acinetobacter tandoii SC36的PPK1-44蛋白在进化上与Acinetobacter tandoii DSM1470的PPK1蛋白属于同一分支。根据多种细菌的PPK蛋白理化性质预测结果（表1），ppk1-44所编码的PPK1-44蛋白的分子量约为78.86 k D，稳定系数为39.52，总平均疏水性为-0.241，预测PPK1-44是稳定的亲水性蛋白，同时可以看到不同菌株的PPK1的总平均疏水性均为负值，预测PPK1蛋白均是亲水性蛋白，其中除来源于Acinetobacter tandoii的PPK蛋白稳定系数小于40外，来源于其他菌种的PPK蛋白均大于40，稳定性不高。