《表1 At GRP7, Br GRP1, BcGRP1基因的详细信息》

《表1 At GRP7, Br GRP1, BcGRP1基因的详细信息》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《不结球白菜富含甘氨酸RNA结合蛋白基因(BcGRP1)的克隆与分析》


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注:RRM:RNA识别基序;aa:氨基酸Note:RRM:RNA recognition motif;aa:Amino acid

将BcGRP1基因与与拟南芥(AtGRP7)以及大白菜中同源基因(BrGRP1)所编码的氨基酸进行比对,分析结果表明BcGRP1与BrGRP1序列的相似性高达99%,与AtGRP7序列的相似性也高达94%(图4),说明不同植物中GRP基因的保守性较高。对这三个基因的结构进行分析,发现它们都是由两个外显子以及一段内含子组成,并且它们的第一个外显子长度完全相同,都是114 bp;不结球白菜与大白菜第二个外显子的长度也相同,都为393 bp,而拟南芥的第二个外显子比它们两个的长,三者的内含子长度各不相同(表1)。通过SMART网站对AtGRP7、BrGRP1、BcGRP1这三个蛋白的结构进行分析,发现这三个蛋白N端都有一个RRM结构,且他们长度相同,由74个氨基酸组成,位于第9~82个氨基酸之间。通过序列比对,对这三个蛋白的RRM序列进行分析(图5),结果表明这三个蛋白的RRM序列非常保守,它们的同源性高达94%,这与之前报道的结论一致。RRM结构中有两段保守的核糖核蛋(ribonucleoproteins,RNP)结构,被命名为RNP1和RNP2,它们是RRM的活性位点,对这两个活性位点进行了标注(图5)。