《表1 ERF在大薯基因组中的详细信息》

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《大薯ERF基因家族的挖掘与特征》


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根据已经公布的大薯表达序列与拟南芥的AtERF基因进行比对,找到41个DaERF基因跟AtERF的匹配程度最高(e-value≤1e-10)。为了分析DaERF的基因结构,我们将Da ERF的EST序列与大薯基因组序列进行比对,找到匹配最高的基因组位置(表1)。在分析的41个DaERF中,14个基因有一个以上的外显子,其余的都是单个外显子。为了对这些DaERF进行进化关系的分析,我们使用blastX搜索ERF保守结构域AP2,去掉不包含AP2保守域和冗余的基因后,共筛选出30个DaERF基因用于后续进行进化树的构建。