《表1 推定的TkMPK基因详细信息》
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《橡胶草促分裂活化蛋白激酶(MPK)基因家族进化和表达谱分析》
从NCB I调取模式生物拟南芥(Arabidopsis thaliana)和水稻(Oryza sativa)的MPK家族成员序列,用于本地BLAST鉴定橡胶草MPK基因。BLASTP程序共识别出42个TkMPK候选基因(E value<10-5)。经Pfam确定蛋白激酶结构域和MPK保守活性中心序列后,最终得到21个可靠的TkMPKs(表1)。这21个TkMPKs的开放读码框(ORF)长度分布为1 110 bp(TkMPK21)~1 923 bp(TkMPK12),其编码的蛋白质长度为370~640个氨基酸。基因组定位分析显示,TkMPK家族成员分布在21个基因组脚手架片段(scaffold)上,通过分析MPK基因的同源性,共鉴定出3组基因复制事件,涉及7个基因(TkMPK14/TkMPK11/TkMPK5,TkMPK7/TkMPK10,TkMPK17/TkMPK18),虚线示出(图1)。
图表编号 | XD00131409700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.12.28 |
作者 | 肖君涵、靳翔 |
绘制单位 | 海南师范大学生命科学学院热带岛屿生态学教育部重点实验室、海南师范大学生命科学学院热带岛屿生态学教育部重点实验室 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |