《表1 推定的TkMPK基因详细信息》

《表1 推定的TkMPK基因详细信息》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《橡胶草促分裂活化蛋白激酶(MPK)基因家族进化和表达谱分析》


  1. 获取 高清版本忘记账户?点击这里登录
  1. 下载图表忘记账户?点击这里登录

从NCB I调取模式生物拟南芥(Arabidopsis thaliana)和水稻(Oryza sativa)的MPK家族成员序列,用于本地BLAST鉴定橡胶草MPK基因。BLASTP程序共识别出42个TkMPK候选基因(E value<10-5)。经Pfam确定蛋白激酶结构域和MPK保守活性中心序列后,最终得到21个可靠的TkMPKs(表1)。这21个TkMPKs的开放读码框(ORF)长度分布为1 110 bp(TkMPK21)~1 923 bp(TkMPK12),其编码的蛋白质长度为370~640个氨基酸。基因组定位分析显示,TkMPK家族成员分布在21个基因组脚手架片段(scaffold)上,通过分析MPK基因的同源性,共鉴定出3组基因复制事件,涉及7个基因(TkMPK14/TkMPK11/TkMPK5,TkMPK7/TkMPK10,TkMPK17/TkMPK18),虚线示出(图1)。