《表2 Xa23启动子与等位xa23启动子序列分析》

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《水稻抗白叶枯病基因Xa23启动子变异及功能标记》

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对Xa23启始密码子上游200 bp序列进行比较分析。结果显示：在启始密码子ATG上游200 bp的序列中，EBEavr Xa23位于-125～-98 bp之间，EBEavr Xa23等位序列（ebeavr Xa23）在其他水稻种质存在着丰富的变异，可以分为8种单倍型。除‘IR24’、‘长药野生稻’、‘巴蒂野生稻’、‘非洲野生稻’与EBEavr Xa23不存在明显一致性序列的H0类型外，EBEavr Xa23还存在至少7种单倍型，如以CBB23为代表的单倍型H1，以JG30为代表的单倍型H2，以9311为代表的单倍型H3，南方野生稻为代表的单倍型H4，南方野生稻为代表的单倍型H5，‘日本晴’为代表的单倍型H6，野生稻200为代表的单倍型H7 （图2）。通过对启始密码子上游的200 bp的核苷酸序列比较，发现在所有34组Xa23/xa23启动子序列中，EBEavr Xa23序列只存在于CBB23中，其次核苷酸序列一致性最高的为以JG30为代表的H2单倍型，一致性在98%～99%之间；最低为与EBEavr Xa23不存在明显一致性序列的H0类型，一致性介于35%～46%之间（表2）。