《表4 Reads中SNP的分布情况统计》

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《番茄果皮开裂的转录组分析》

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使用BCFtools统计各样品中的SNP/In Del的数量，并利用Snp Eff统计变异位点在基因组上的分布。与NC果皮相比，CK果皮的In Del数量差异不明显，SNP数目减少，说明果实开裂后，转换或颠换的数量降低，但突变时，转换与颠换的比例基本持平（表4）。基因间、基因内、基因保守区、5'非编码、3'非编码区和剪接位点等均有SNP突变，但突变主要集中在基因内部（图2；表4）。这说明番茄果实开裂后，植物基因组减少了点突变数量，这可能与果实开裂后植物生长发育受到抑制有关。