《表2 铁皮石斛叶片转录组测序质量》

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《小菇促进铁皮石斛光合作用的转录组分析》

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Q30:测序质量值Phred大于30碱基占总体碱基百分比；GC/%:G和C占总碱基数量百分比；N/ppm:每百万碱基N数量；CKD:对照白天；CKN:对照黑夜；MD:小菇白天；MN:小菇黑夜。

统计铁皮石斛叶片转录组测序结果，小菇处理白天（MD）获得18 826个基因，对照白天（CKD）获得18 563个基因，差异表达基因（differentially expressed genes，DEGs）658个，约占MD的3.50%。小菇黑夜（MN）19 088个基因，对照黑夜（CKN）19 159个基因，427个DEGs，约占CKN的2.23%（图2-A）。小菇处理与对照相比，无论白天还是黑夜都有146个DEGs（图2-B），提示小菇虽然没有广泛影响石斛叶片基因组转录，但也能调控少数基因的昼夜表达。铁皮石斛昼夜对比（CKD-VS-CKN）有453个DEGs，约占CKN的2.24%，小菇处理后昼夜对比（MD-VS-MN）有749个DEGs，约占MN的3.92%，上调和下调DEGs数量均高于对照（图2-A），其中586个DEGs由小菇处理诱导差异表达（图2-B），暗示小菇增强了铁皮石斛基因昼夜间的差异性表达，对叶片基因组转录具有调控作用。