《表2 用于甜味受体同源建模的不同模板的比较》
通过BLAST搜索来寻找与甜味受体hT1R2和hT1R3间有较高相似性的模板。该方法基于模板与目标序列间的序列一致性和E值来进行选择,序列一致性越高且E值越低,模板与目标序列间相似性越高,更适合用于同源建模[19]。搜索结果显示青鳉鱼味觉受体T1R2-T1R3配体结合域晶体结构的B链(PDB ID:5X2M_B)与hT1R2和hT1R3受体间最为相似。与此前研究者们用于甜味受体同源建模的模板3LMK_A[19]、2E4U_A[24]、1EWK_A[25]相比,它与hT1R2和hT1R3间有最高的序列一致性和最低的E值,如表2所示。因此,选用5X2M_B作为构建甜味受体同源模型的理想模板。
图表编号 | XD00174148500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.01 |
作者 | 李伟、王海军、夏咏梅 |
绘制单位 | 食品科学与技术国家重点实验室江南大学、江南大学化学与材料工程学院、江南大学化学与材料工程学院、食品科学与技术国家重点实验室江南大学、江南大学化学与材料工程学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |