《表2 PEDV参考毒株信息Table 2 Information of PEDV reference strains》

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《猪流行性腹泻病毒变异株GDqy2017的分离及S和ORF3基因序列分析》


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注:S和O分别代表S基因和ORF3基因序列登录号,未标注的为全基因序列登录号。Note:S and O represent the GenBank accession numbers of the Sand ORF3gene sequences,and others represent the GenBank accession numbers of the full genome sequences.

利用DNA Star软件对测得S基因相关序列进行拼接,获得S基因全序列。登录NCBI GenBank下载国内外PEDV分离株和疫苗株的S基因和ORF3基因序列做参考(PEDV参考毒株信息见表2),利用DNA Star及Biodit软件进行序列比对分析,同时利用MEGA6.0软件选择NJ方法(Bootstrap 1 000)对核苷酸序列进行遗传进化分析。