《表1 PEDV参考毒株信息》

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《一例病毒性腹泻的诊断与防治》


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笔者将编号180366-1的S基因部分序列进行扩增和测序,并对测序结果进行序列核苷酸同源性分析和遗传进化分析,以确定PEDV毒株是否为流行株。结果表明,该样品在532 bp处有特异性扩增条带(图1,B),与预期相符。该毒株与参考毒株序列(表1)的同源性为82.7%~98.2%(图3),与XX的同源性最高,为98.2%;与CV777的同源性仅为82.7%。根据S基因构建的进化树分为2个基因群,第一个基因群又分为3个基因亚群,第二个基因群又分为2个基因亚群(图4)。180366-1属于第1个基因群的第2亚群,为流行株,与HeN-NY-2016最相似。