《表1 PEDV参考毒株信息》
笔者将编号180366-1的S基因部分序列进行扩增和测序,并对测序结果进行序列核苷酸同源性分析和遗传进化分析,以确定PEDV毒株是否为流行株。结果表明,该样品在532 bp处有特异性扩增条带(图1,B),与预期相符。该毒株与参考毒株序列(表1)的同源性为82.7%~98.2%(图3),与XX的同源性最高,为98.2%;与CV777的同源性仅为82.7%。根据S基因构建的进化树分为2个基因群,第一个基因群又分为3个基因亚群,第二个基因群又分为2个基因亚群(图4)。180366-1属于第1个基因群的第2亚群,为流行株,与HeN-NY-2016最相似。
图表编号 | XD00126948400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.10 |
作者 | 李凡、赵坤坤、刘守川 |
绘制单位 | 洛阳中科基因检测诊断中心有限公司、洛阳中科基因检测诊断中心有限公司、洛阳中科基因检测诊断中心有限公司 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |