《表2 2016年黑龙江地区PEDV流行毒株信息Table 2 Information on PEDV epidemic strains in Heilongjiang in 2016》

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《2016年黑龙江省猪流行性腹泻病毒S1基因的遗传变异分析》


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注:(a,b)代表来源于同一猪场;—代表来源信息未知。

对鉴定的PEDV毒株S1基因进行克隆与序列测定,其中10株PEDV毒株的S1基因测序成功,将测序结果提交至Gen Bank,见表2。测序结果显示,S1基因长度为2 396 bp,S1基因的序列比对显示,核苷酸序列同源性为96.2%~99.7%,推导出的氨基酸序列同源性为96.2%~99.5%;与经典毒株CV777比较显示,核苷酸序列同源性为92.1%~92.6%,推导的氨基酸序列同源性为90.5%~91.4%。分析显示:本研究鉴定的毒株S1基因与中国FJ-FQ 2014野毒株、中国HGC-01-2015野毒株和美国经典毒株USA/Colorado/2013同源性较高;与经典毒株CV777、中国早期分离毒株LZC以及其他亚洲、欧洲的代表性毒株进行序列比对,同源性较低。PEDV S1基因序列分析见表3。