《表1 TERT基因序列信息》

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《金乌贼端粒酶逆转录酶基因鉴定和组织差异表达分析》


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从课题组前期获得的金乌贼卵巢转录组数据(Zhang et al,2019)中筛到疑似TERT基因片段序列信息。将疑似金乌贼TERT基因序列信息与NCBI数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov)下载的已知物种TERT基因序列比对分析(表1)。用ClustalX对所有序列进行比对排序并去除两端冗余序列,保留共有序列2415 bp。使用MEGA6.0软件分析序列的核苷酸组成、变异位点数等,采用邻接法(Neighbour-joining,NJ)构建分子系统进化树,经1000次重复抽样(Bootstraps)检测其置信度(图1)。同时,使用DNAman软件,保留共有序列,对金乌贼以及其相物种进行同源序列分析,确定该序列与已知TERT基因的同源性。