《表1 TERT基因序列信息》
从课题组前期获得的金乌贼卵巢转录组数据(Zhang et al,2019)中筛到疑似TERT基因片段序列信息。将疑似金乌贼TERT基因序列信息与NCBI数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov)下载的已知物种TERT基因序列比对分析(表1)。用ClustalX对所有序列进行比对排序并去除两端冗余序列,保留共有序列2415 bp。使用MEGA6.0软件分析序列的核苷酸组成、变异位点数等,采用邻接法(Neighbour-joining,NJ)构建分子系统进化树,经1000次重复抽样(Bootstraps)检测其置信度(图1)。同时,使用DNAman软件,保留共有序列,对金乌贼以及其相物种进行同源序列分析,确定该序列与已知TERT基因的同源性。
图表编号 | XD00161745500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.01 |
作者 | 项子龙、刘长琳、张金勇、胡鹏、何暮春、柳淑芳、庄志猛、薛同明 |
绘制单位 | 上海海洋大学水产与生命学院、中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室、青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室、中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室、中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室、青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室、南京农业大学无锡渔业学院、中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室、青岛海洋科学与技术试点国家实 |
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