《表1 分段扩增waxy基因的引物》

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《waxy基因功能标记开发及在糯玉米育种中的应用》


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分别取10粒自交系昌7-2和糯玉米自交系云539的种子在光温培养箱中培养14d,采集幼嫩叶片,采用简化CTAB法[23-25]快速提取基因组DNA。从NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)网站下载玉米显性非糯质基因Wx的碱基序列(Gen Bank No.:X03935),利用Primer 5.0软件,在相对保守的外显子区域设计特异的PCR引物(表1),分段扩增糯玉米自交系云539的隐性糯质基因wx和普通玉米自交系昌7-2的显性非糯质基因Wx,扩增产物由北京六合华大基因科技有限公司进行PCR产物的测序。利用Bioedit软件进行序列拼接与比对,发掘显性Wx基因与隐性wx基因序列差异。根据序列差异,寻找引起显性Wx基因功能变异的功能基序。在功能基序的两侧利用Primer 5.0软件设计引物,开发1对共显性功能标记。