《表3 正交试验设计因素及水平》

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《华山松SSR-PCR反应体系优化》


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从6个华山松种源的样品中各选一个无性系,以其基因组DNA为模板,利用初筛出的SSR引物进行SSR-PCR反应体系优化。以引物(10μmol/L)、d NTPs(10 mmol/L)、Taq DNA聚合酶(5 U/μL)和DNA模板(50 ng/mL)的用量为4个因素进行L16(44)正交试验(李春喜等,2008)。每个因素设4个水平(表3),2次重复,每重复16个组合。按照表4配制SSR-PCR反应体系,各体系均加入2.00μL10×PCR Buffer缓冲液,用ddH2O补足至20.00μL。扩增程序:94℃预变性5 min;94℃50 s,52℃90 s,72℃1 min,进行30个循环;72℃延伸10 min,扩增产物4℃保存。