《表1 HMGR1基因氨基酸序列比对》
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《茅苍术两个HMGR基因(AlHMGR)的克隆与分析》
利用DNAMAN分析测序所得到的AlHMGR1、AlHMGR2序列,AlHMGR1、AlHMGR2的开放序列框(ORF)分别为1 749 bp、1 770 bp,编码582个及589个氨基酸(图3)。进一步查阅文献发现,HMGR有4个高度保守基序:2个位于C端的HMG-CoA结合基序(EMPVGYVQIP和TTEGCLVA)和2个位于N端的NADP(H)结合基序(DAMGMNM和GTVGGGT)(Li et al.,2014;袁岐等,2017)。利用BLAST进行氨基酸的比对,显示AlHMGR的保守性较高,将保守性较高的10条序列列出,发现都与朝鲜蓟最高,且相似性较高的都是菊科植物(表1;表2),这点符合传统分类学结论。另外,本研究所得HMGR2能与GenBank中已有的苍术HMGR有较高的相似性。将本研究的2条苍术AlHMGR与已知的苍术、拟南芥HM-GR基因进行比对,可找出高度保守基序,并将其用方框标注(图3)。
图表编号 | XD00156633600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.25 |
作者 | 陈丽娜、万倩芸、邓娟、明淑芳、龚玲、余坤、徐建中、吴楠 |
绘制单位 | 湖北中医药大学药学院、湖北中医药大学药学院、湖北中医药大学药学院、湖北中医药大学药学院、湖北中医药大学药学院、湖北中医药大学药学院、黄冈市卫尔康医药有限公司、黄冈市卫尔康医药有限公司 |
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