《表1 HMGR1基因氨基酸序列比对》

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《茅苍术两个HMGR基因(AlHMGR)的克隆与分析》


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利用DNAMAN分析测序所得到的AlHMGR1、AlHMGR2序列,AlHMGR1、AlHMGR2的开放序列框(ORF)分别为1 749 bp、1 770 bp,编码582个及589个氨基酸(图3)。进一步查阅文献发现,HMGR有4个高度保守基序:2个位于C端的HMG-CoA结合基序(EMPVGYVQIP和TTEGCLVA)和2个位于N端的NADP(H)结合基序(DAMGMNM和GTVGGGT)(Li et al.,2014;袁岐等,2017)。利用BLAST进行氨基酸的比对,显示AlHMGR的保守性较高,将保守性较高的10条序列列出,发现都与朝鲜蓟最高,且相似性较高的都是菊科植物(表1;表2),这点符合传统分类学结论。另外,本研究所得HMGR2能与GenBank中已有的苍术HMGR有较高的相似性。将本研究的2条苍术AlHMGR与已知的苍术、拟南芥HM-GR基因进行比对,可找出高度保守基序,并将其用方框标注(图3)。