《表1 波罗蜜嫩茎测序结果的数据分析》

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《波罗蜜叶绿素缺失突变体嫩茎转录组分析》


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结果显示,CK1、CK2、CDM1、CDM2、CDM3测序原始数据分别为72.28 M、64.08 M、72.69 M、70.18 M和70.18 M,去接头和低质量序列后分别得到69.29 M、60.77 M、69.95 M、67.45 M和67.58 M高质量数据,且Q20均高于97%,Q30均高于88%,数据比对效率均大于94%。各样品的GC含量稳定在38.5%~42.5%范围内,且N50长度均高于1200 bp(表1)。同组样品基因表达模式趋于一致且Pearson相关系数均大于0.72,主成分分析(principal component analysis,PCA)结果表明两组处理之间是相互独立的(图2)。