《表1 黄瓜与西芹间作土壤真菌的测序数据质量结果》

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《黄瓜与西芹间作对黄瓜土壤真菌ITS多样性分析》

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ITS测序得到的原始图像文件数据为经过base calling以FASTQ格式存储后称之为raw data或raw reads。对原始数据去除reads的barcode和接头序列，将每一对paired-end reads拼接合并成一条更长的tag，去除含有无法确定的碱基信息比例大于5%的tags和低质量的tags（碱基质量值Q<10的碱基数占整个tag的20%以上）得到Clean数据。对Clean数据进行长度分布统计和质量评估。本试验中各样品经优化处理的测序数据统计结果如表1所示，达到测序要求，可进行下一步测序分析。