《表1 黄瓜（‘6457’ב6426’）单性结实性状QTL-Seq测序数据质量分析》

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《黄瓜单性结实性状遗传与QTL定位》

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对亲本P1、P2及20株强单性结实株系组成的混池（par）和20株弱单性结实株系组成的混池（np）开展全基因组重测序，共得到24.945 G原始数据，过滤后4个样本有效数据量在4 004.935—7 672.465 M，总数据量23.567 G。利用测序结果的QPhred数值（Phred Score，Q），计算碱基错误率，发现Q20≥93.99%、Q30≥87.01%，碱基错误率低于0.03%，测序质量高，GC含量在38.80%—39.84%之间（表1）。以黄瓜基因组作为参考基因组，参考基因组大小为197 271 687 bp，所有样本的比对率在87.06%—88.14%，对参考基因组（排除N区）的平均覆盖深度在12.40—21.61 X，1X覆盖度（至少有一个碱基的覆盖）在97.21%以上（表2）。