《表1 高通量测序生物样本信息》

《表1 高通量测序生物样本信息》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《大黄鱼消化道菌群结构、消化酶和非特异性免疫酶活力分析》


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将液氮中保存的样本取出,冰上自然解冻,随机选取3条鱼的消化道作为平行样本,每个消化道组织均匀剪取一部分用于DNA提取,剩余部分用于酶活检测。采用QIAamp DNA Mini Kit(QIAGEN,德国)试剂盒提取组织样本和饲料样本微生物总DNA;采用OMEGA Soil DNA Kit(Omega Bio-Tek,美国)试剂盒提取处理水样所得滤膜的微生物总DNA。共27个生物样本用于微生物总DNA的提取,具体信息见表1。将通过各试剂盒提取的微生物总DNA进行PCR扩增,扩增序列为16s rDNA V3~V4高变区的序列,选取引物338F(5′-ACTCCTACGGGAGGCAGCA-3′)和806R(5′-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3′),经琼脂糖凝胶电泳检测合格后,构建文库,通过Illumina MiSeq PE300平台进行高通量测序。