《表1 2种腐乳样本中细菌(a)和真菌(b)高通量测序数据汇总》

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《基于高通量测序分析2种夹江腐乳中的微生物》


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通过Illumina Miseq测序共获得187 204条序列,其平均读长425 bp,范围为400~450 bp,其中香辣腐乳和白菜腐乳中微生物序列的平均读长分别为426 bp和424 bp。对2种样本的测序结果进行多样性指数分析,可估计环境群落的物种丰度和多样性,并衡量测序数据的合理性。由表1可知,Chao和Ace指数在同一样本下数值相同,说明物种总数估计结果可靠,其中香辣腐乳和白菜腐乳细菌OTUs均为62,真菌OUTs分别为19和27。根据Shannon和Simpson指数,可知白菜腐乳中细菌的群落多样性高于香辣腐乳,而香辣腐乳中真菌的多样性高于白菜腐乳。由此可见,白菜腐乳中真菌OTU数较高,而其多样性不及香辣腐乳。Coverage指数值在表1中均达0.9999,说明样本文库覆盖率很高,本次测序结果可代表样本中细菌和真菌的真实情况。