《表1 不同连作年限山地丹参根际土壤细菌群落高通量测序文库汇总》

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《不同连作年限山地丹参根际土壤细菌群落结构变化及其多样性分析》

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通过对土壤基因组DNA测序结果进行去杂等质控步骤后，CK、Y1及Y2分别得到拼接序列为31 000条、14 748条及10 042条，经嵌合体序列去除后，得到有效序列分别为28 205条、13 847条及9 269条，有效率分别为90.98%、93.89%及92.30%。后经RDP数据库的注释及OTU分析，得到细菌OUT的数量分别为3 832、1 989及1 295种（表1）。其中Y1、Y2较CK OTU种类数目分别下降47.97%及66.13%。