《表2 5株小黄姜内生细菌的比对情况》
将测序结果用Blast软件进行比对分析,找出相似度最高的序列作为同源序列(表2),并构建系统发育树(图3)。小黄姜内生菌16S rRNA序列测序比对,结果发现5株菌的16S rRNA与GENE-BACK中已知16S rRNA序列最高相似性均在99%以上,其中3株菌的相似度为100%,说明这5株内生菌均为已知菌(表2)。分析发现,5株菌属于2个科5个属,GrsB1属于芽孢杆菌科,GrsB2、GrsB3、GrsB4、GrsB5属于肠杆菌科,数量最多是优势菌株,5株菌分别属于微小杆菌属(Exiguobacterium)、拉乌尔菌属(Raoultella)、肠杆菌属(Enterobacter)、埃希氏菌属(Escherichia)、沙雷氏菌属(Serratia)。从系统发育树可以看出5株菌聚为两个大类,GrsB1属于阳性菌,单独聚为一支,其余4株菌属于阴性菌聚为一支。5株菌都单独聚为一支,说明其遗传关系较近。
图表编号 | XD00141993200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.03.05 |
作者 | 刘青、李悦欣、赵德刚、赵懿琛 |
绘制单位 | 贵州大学山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室·贵州省农业生物工程重点实验室·贵州大学生命科学学院·贵州大学茶学院、贵州大学山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室·贵州省农业生物工程重点实验室·贵州大学生命科学学院·贵州大学茶学院、贵州大学山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室·贵州省农业生物工程重点实验室·贵州大学生命科学学院·贵州大学茶学院、国家农业部植物新品种DUS测试贵阳分中心·贵州省农业科学院、贵州大学山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室·贵州省 |
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