《表2 番茄CIPK顺式作用元件分析Table 2 Cis-elements analysis of tomato CIPK genes》

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《番茄CIPK基因家族鉴定及生物信息学分析》


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注:ABRE为脱落酸应答元件;Box-W1为真菌病原物应答元件;CGTCA-motif为茉莉酸甲酯应答元件;GARE-motif为赤霉素响应元件;HSE为热胁迫应答元件;LTR为冷胁迫应答元件;MBS为干旱胁迫应答元件;TC-rich repeats为防卫和逆境应答元件;TCA-element为水杨酸应答元件;W-box为防卫应答元件

番茄CIPK基因家族成员上游1 500 bp存在多个与植物逆境应答相关顺式作用原件,其中77%(17/22)成员具有TC-richment顺式作用原件,说明大多数成员均与防卫和逆境应答相关;68%(15/22)成员具有HSE作用原件,说明与响应热胁迫相关;36%(8/22)成员具有LTR顺式作用原件,说明可能与冷胁迫应答相关;36%(8/22)成员具有茉莉酸甲酯应答元件;36%(8/22)成员具有BOX-W1原件说明这些基因在真菌侵染后可能发挥作用,且具BOX-W1原件的CIPK成员均有w-box原件;7个CIPK家族成员存在ABRE原件,说明32%成员可能与脱落酸应答相关;7个CIPK家族成员存在MBS原件,说明32%成员与干旱胁迫相关;仅4个基因具有TCA原件,可能与水杨酸应答相关(见表2)。