《表2 五味子ScPLR启动子顺式作用元件分析》
通过在线软件PlantProm分析ScPLR基因起始密码子ATG上游序列,预测显示该序列的转录起始位点(transcription start site,TSS)位于ATG上游193 bp处。利用PlantCARE对克隆获得的Sc PLR启动子进行顺式作用元件预测分析(表2),五味子Sc PLR启动子序列中包含5个TATA-box、11个CAAT-box基本元件;10个光响应元件(AE-box、G-box、GAG-motif、MNF1、Sp1、TCCC-motif),这些光响应元件大多来源于玉米和拟南芥,较少来源于菠菜;1个生长素响应元件(TGA-element),来源于甘蓝;5个厌氧诱导顺式调控元件(ARE);1个参与防御和胁迫响应的顺式调控元件(TC-rich repeats);2个参与抗旱诱发的MYB结合位点的作用元件(MBS);1个来源于玉米的与蛋白代谢有关的作用元件(O2-site);3个来源于稻的涉及胚乳表达的调控元件(Skn-1_motif),1个高转录水平的5UTR Py-rich stretch。以上分析表明,五味子Sc PLR基因的转录表达调控与多种因素有关,该基因启动子很可能与组织特异性表达有关,而且这些顺式作用元件能够响应外界环境的变化,从而调控ScPLR基因的表达。
图表编号 | XD00159189500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.09.28 |
作者 | 李海燕、刘久石、魏如滨、王婷、刘宇阳、王熙昂、李宏博 |
绘制单位 | 沈阳农业大学园艺学院、中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所、沈阳农业大学园艺学院、沈阳农业大学园艺学院、沈阳农业大学园艺学院、沈阳农业大学园艺学院、沈阳农业大学园艺学院 |
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