《表4 苹果Trihelix启动子区域顺式作用元件分析》

《表4 苹果Trihelix启动子区域顺式作用元件分析》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《苹果Trihelix转录因子家族生物信息学鉴定与基因表达分析》


  1. 获取 高清版本忘记账户?点击这里登录
  1. 下载图表忘记账户?点击这里登录

为了鉴定苹果Trihelix基因启动子上游1 kb顺式作用元件,在该转录因子家族基因启动子上游1 kb的碱基序列中进行搜索(表4),结果表明,苹果Trihelix基因启动子含有较丰富的顺式作用元件,包括启动子、增强子区域的作用元件CAAT-box(核心序列为CAAT)、茉莉酸响应元件CGTCA-motif(核心序列为CGTCA)、脱落酸响应元件ABRE(核心序列为ACGTG)和光响应元件GT1-motif(核心序列为GGTTAA)。MdTrihelix1、MdTrihelix2、MdTrihelix7、MdTrihelix11、MdTrihelix14、MdTrihelix21和MdTrihelix28都含有上述4种顺式作用元件,其余基因在响应CGTCA-motif、ABRE和GT1-motif元件上有差异。MdTrihelix1、MdTrihelix19在CGTCA-motif上,MdTrihelix6、MdTrihelix13在ABRE上,MdTrihelix2、MdTrihelix7、MdTrihelix14、MdTrihelix16、MdTrihelix24和MdTrihelix39在GT1-motif上的响应均较高。