《表4 苹果Trihelix启动子区域顺式作用元件分析》
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《苹果Trihelix转录因子家族生物信息学鉴定与基因表达分析》
为了鉴定苹果Trihelix基因启动子上游1 kb顺式作用元件,在该转录因子家族基因启动子上游1 kb的碱基序列中进行搜索(表4),结果表明,苹果Trihelix基因启动子含有较丰富的顺式作用元件,包括启动子、增强子区域的作用元件CAAT-box(核心序列为CAAT)、茉莉酸响应元件CGTCA-motif(核心序列为CGTCA)、脱落酸响应元件ABRE(核心序列为ACGTG)和光响应元件GT1-motif(核心序列为GGTTAA)。MdTrihelix1、MdTrihelix2、MdTrihelix7、MdTrihelix11、MdTrihelix14、MdTrihelix21和MdTrihelix28都含有上述4种顺式作用元件,其余基因在响应CGTCA-motif、ABRE和GT1-motif元件上有差异。MdTrihelix1、MdTrihelix19在CGTCA-motif上,MdTrihelix6、MdTrihelix13在ABRE上,MdTrihelix2、MdTrihelix7、MdTrihelix14、MdTrihelix16、MdTrihelix24和MdTrihelix39在GT1-motif上的响应均较高。
图表编号 | XD00127473700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.11.25 |
作者 | 王萍、卢世雄、梁国平、马宗桓、李文芳、毛娟、陈佰鸿 |
绘制单位 | 甘肃农业大学园艺学院、甘肃农业大学园艺学院、甘肃农业大学园艺学院、甘肃农业大学园艺学院、甘肃农业大学园艺学院、甘肃农业大学园艺学院、甘肃农业大学园艺学院 |
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