《表1 水稻谷蛋白基因在籽粒中的表达量 (RPKM)》

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《稻米贮藏蛋白家族的生物信息学分析》


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基因名称中,括号内基因名称为本研究建议命名名称。

水稻谷蛋白基因的表达量基本表现为灌浆早期表达量较低,而后表达量急剧升高,到后期表达量又有所降低。花后25 d的籽粒中谷蛋白基因表达除了LOC_Os08g03410明显表现为胚乳中表达量远高于胚中的表达量,也说明谷蛋白基因的表达并不是严格的胚乳特异性表达。LOC_Os08g03410的表达模式与其他谷蛋白基因明显不同,在花后25 d,胚中的表达量达到36 316.4 RPKM(Read Per Kilobase per Million),而胚乳中的表达量只有990.4 RPKM,说明LOC_Os08g03410倾向于在胚中特异表达。15个谷蛋白基因中,Glu A-1和Glu A-2的表达水平最高,花后10 d籽粒中的表达量分别达到55 337.8 RPKM和38 553.9 RPKM。Glu A-3、Glu B-1a、Glu B-1b、Glu B-2、Glu B-4、Glu B-5、Glu C-1的表达量处于同一水平,花后10 d表达量都在15000~20 000 RPKM之间。Glu B-7、Glu B-6、Glu D-1、LOC_Os01g55630、LOC_Os02g25860的表达量相对较低(见表1)。