《表3 蛋白质亲水性：8种易裂果实中果胶酶生物信息学分析》

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《8种易裂果实中果胶酶生物信息学分析》

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蛋白质的亲水性和疏水性是组成其所有氨基酸亲水性和疏水性的平均表现，氨基酸的亲水性或疏水性是由所带基团决定的，根据相似相溶，极性基团能够与水亲和，而非极性基团亲和力则比较小。通过对拟南芥和8种水果的果胶酯酶和多聚半乳糖醛酸酶的亲水性和疏水性进行预测（表3）：拟南芥（图1a）和所有果胶脂酶都表现为亲水性，番茄果胶脂酶亲水性较小，仅为-0.086。在所有的多聚半乳糖醛酸酶中，拟南芥（图1b）、苹果、桃、甜橙、甜樱桃的多聚半乳糖醛酸酶表现为疏水性，其余4种则表现为亲水性。在所有的酶蛋白亲水性和疏水性预测中，最强疏水性位置多在丙氨酸（Ala）、缬氨酸（Val）、亮氨酸（Leu）、异亮氨酸（Ile）、苯丙氨酸（Phe）等非极性氨基酸上和少数在中性天冬酰胺（Asn）上，最强亲水性位置多在谷氨酰胺（Gln）、半胱氨酸（Cys）、酪氨酸（Tyr）等极性氨基酸和天冬氨酸（Asp）、谷氨酸（Glu）等酸性氨基酸上。通过了解蛋白质的亲水性和疏水性，可以知道其作用环境，在亚细胞定位上也有一定程度的指示作用。