《表2 绞股蓝4个重要靶点的分子对接》

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《基于网络药理学结合分子对接方法探讨绞股蓝治疗非小细胞肺癌的作用机制》


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在PPI分析中,度值越大意味着该节点在整个网络中占据重要地位。本研究选取上述度值前4位的蛋白与绞股蓝活性成分进行分子对接验证,结果详见表2。一般认为docking score值>7.0表明活性成分与靶点具有强烈的结合活性,>5.0表明两者有较好的结合活性,>4.25表明有一定的结合活性[8]。分子对接结果表明,绞股蓝的活性成分与NSCLC相关靶点的结合性较好。制定2个筛选潜在核心化合物的标准:(1)与4个靶点对接,其中对接得分最高的化合物分别为:槲皮素(quercetin)(与VEGFA)、菠菜甾醇(spinasterol)(与CCND1)、谷甾醇(sitosterol)(与EGFR)、胆甾醇(CLR)(与ESR1)。将上述5对靶点化合物放入PyMOL软件中进行优化,具体对接蛋白与配体的相互作用如图3所示;(2)与4个重要靶点对接得分均>5的化合物,满足这2个条件的化合物谷甾醇、菠菜甾醇、胆甾醇被认为可能是潜在的核心化合物。