《表2 样本羊突变位点数据统计单位:个》

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《阿尔巴斯绒山羊产绒量性状相关基因挖掘的研究》


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6只样本羊经基因组重测序获得637 Gb的原始数据,以及4.219×109个reads,96.91%的reads100%对应到参考基因组上,表明该试验获得较高质量的reads。每只山羊基因组的平均序列覆盖率为30×,GC含量正常。由表2可知,实验绒山羊的单核苷酸多态性(SNPs)为7 616 112~8 682 843个,多核苷酸多态性(MNPs)为132 316~179 446个,插入序列(INS)为441 567~494 305个,缺失序列(DEL)为470 674~535 634个,复杂突变(COM-PLEX)为325 682~443 800个。经过数据过滤和分析,每个只山羊获得700万个SNPs和100万个INS/DEL。分析比对后发现,只有少数SNPs(0.1%~0.6%)和4%的INS/DEL位于编码区域内。