《表3 挖掘8个基因上游启动子需要拼接的次数和时间》
为了估测Promoter_Scan所需要花费的时间,随机挑选枇杷中8个基因进行测试。从转录组中获得转录本,逐一使用Promoter_Scan对每个基因的启动子区域进行染色体步移。统计延伸长度达到2 000 bp所需要拼接的次数和耗时。结果显示拼接次数需要9到14次,平均11.8次。耗时从15.2~28.4 min,平均21.3 min。表3说明通过Promoter_Scan可以显著提高实验效率。
图表编号 | XD00131612400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.01.10 |
作者 | 蒋爽、安海山、徐芳杰、张学英 |
绘制单位 | 上海市农业科学院林木果树研究所·上海市园艺重点实验室、上海市农业科学院林木果树研究所·上海市园艺重点实验室、上海市农业科学院林木果树研究所·上海市园艺重点实验室、上海市农业科学院林木果树研究所·上海市园艺重点实验室 |
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