《表3 挖掘8个基因上游启动子需要拼接的次数和时间》

《表3 挖掘8个基因上游启动子需要拼接的次数和时间》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《应用枇杷二代测序数据进行染色体步移研究》


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为了估测Promoter_Scan所需要花费的时间,随机挑选枇杷中8个基因进行测试。从转录组中获得转录本,逐一使用Promoter_Scan对每个基因的启动子区域进行染色体步移。统计延伸长度达到2 000 bp所需要拼接的次数和耗时。结果显示拼接次数需要9到14次,平均11.8次。耗时从15.2~28.4 min,平均21.3 min。表3说明通过Promoter_Scan可以显著提高实验效率。