《表1 引物列表:鸡miR-17-92基因簇上游A/T富集区启动子活性鉴定与分析》

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《鸡miR-17-92基因簇上游A/T富集区启动子活性鉴定与分析》


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注:斜体表示保护碱基,下划线序列分别为SmaⅠ、KpnⅠ和SalⅠ酶切位点。SmaⅠ酶切位点为CCCGGG;KpnⅠ酶切位点为GG-TACC;SalⅠ酶切位点为GTCGAC。

根据鸡miR-17-92基因簇上游A/T富集区序列,利用Primer Premier 5.0设计引物。以AA肉鸡血液基因组DNA为模板,采用PCR扩增鸡miR-17-92基因簇上游的全长A/T富集区序列、A/T富集区5'端截短突变和3'端截短突变,引物信息见表1。将产物与克隆载体pEASY-T1 Simple Cloning Vector连接。双酶切、测序鉴定无误后,利用pGL3-basic vector构建全长A/T富集区和截短突变体的报告基因载体。PCR反应体系10μL:0.1μL Easy Taq DNA Polymerase,1μL 10×Easy Taq DNAPolymerase Buffer,0.8μL dNTPs,1μL基因组DNA模板,上下游引物各0.2μL,6.7μL ddH2O。PCR反应条件:95℃预变性5 min;经95℃30 s,退火55℃30 s,72℃延伸,共30个循环;72℃终延伸10 min,4℃保存。同时采用基因合成方法,将野生型A/T富集区报告基因载体pGL3-AT-MIR17-92(-1291/-577)的3个E2F1潜在结合位点CCGGGAAA(结合位点1)、CGGCAGAAAATGCGGGA(结合位点2)和ACGCCAAA(结合位点3)分别突变成Eco RⅠ酶切位点GGAATTCC,GGAATTCCAGGAATTCC及G GAATTCC,构建包含E2F1结合位点突变的报告基因载体pGL3-AT-MIR17-92-MUT1(结合位点1),pGL3-AT-MIR17-92-MUT2(结合位点2)和pGL3-AT-MIR17-92-MUT3(结合位点3)。采用双酶切、测序鉴定无误后用于后续分析。