《表2 苹果Co定位区间的基因初步筛选》

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《柱状苹果Co基因的筛选与候选基因分析》

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根据已经发表的柱状基因Co定位区间，提取‘金冠’参考基因组GDDH13 10号染色体27.66—29.05Mb区域内基因组信息，结果表明，这一段序列包含67个基因（表2），其中12个为非编码RNA(ncRNA），其余为编码蛋白质的基因。根据柱状和普通型苹果SRA RNA-seq数据，差异倍数1倍以上的有25个基因，其中13个基因在柱状苹果中上调表达，12个基因在柱状苹果中下调表达。通过比较67个基因在柱状和普通型苹果中的表达并结合基因功能预测，筛选到14个预测基因（表1）。其中，MD10G1192100、MD10G1192900、MD10G1188000、MD10G1194100、MD10G1193400、MD10G1189000和MD10G1192200在叶片、顶梢、茎、腋芽、根、果实和花中均表达（图1）。而MD10G1192900和MD10G1192100的表达量在各个器官中均较高，MD10G1194100和MD10G1187000在根中表达量高，MD10G1192200和MD10G1188000在果实中表达量较高。