《表2 PCR扩增引物序列》
注:16S rRNA的上、下游引物为27F、1492R;ITS的上下游引物为L516SF、L523SR。
提取所筛菌株的基因组D N A作为P C R模板。合成1 6 S r R N A和I T S引物[1 5](由B i o s u n e公司合成),引物序列如表2所示;PCR采用25μL体系:10×PCR Buffer 2.2μL;dNTPs(2.5 mmol/L)2.5μL;d d H2O 1 7.5μL;上下游引物(1 0μmol/L)分别为0.5μL;DNA模板1μL;Taq酶0.5μL。16S rRNA的PCR设定程序为:94℃预变性3 min,94℃变性30 s,52℃退火30 s,72℃延伸75 s,共30个循环;ITS的PCR设定程序为:94℃预变性3 min,94℃变性30 s,53℃退火30 s,72℃延伸30 s,共30个循环;使用无菌的ddH2O作为阴性对照。PCR产物用1%的琼脂糖凝胶电泳鉴定,经纯化回收后交由Biosune公司测序。使用NCBI数据库的BLAST程序对测序的16S rRNA、ITS基因序列进行同源性比对,并用MEGA 7.0软件通过Neighbor-Joining法构建系统发育树[18]。
图表编号 | XD00123351500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.01.25 |
作者 | 刘彦敏、沈璐、王康、严金平、伊日布斯 |
绘制单位 | 昆明理工大学生命科学与技术学院、昆明理工大学生命科学与技术学院、昆明理工大学生命科学与技术学院、昆明理工大学生命科学与技术学院、昆明理工大学生命科学与技术学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |