《表4 从青菜头原料中鉴定出的Staphylococcus和Rhodococcus属信息统计》

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《榨菜腌制过程中变红或产膜现象相关微生物的分离鉴定》

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采用Illumina Miseq对青菜头原料表面微生物DNA的16S rDNA基因V3-V4区段进行高通量测序，鉴定细菌的种类构成，总共产生了53 624条raw reads，平均序列长度为447.58 bp，Coverage 1.000，测序深度满足生物信息学分析要求。鉴定出OTU总数为173，门、纲、目、科、属、种数量分别为：7、12、29、52、91、132。最优势的属为Pseudomonas（62.54%），其他优势属（相对丰度>1%的）还包括：unclassified＿f＿Enterobacteriaceae(6.34%），norank＿c＿Cyanobacteria（6.34%），Erwinia（3.80%），Acinetobacter（2.79%），Janthinobacterium（2.70%），Duganella（2.67%），Chryseobacterium（2.61%），Flavobacterium(2.34%）（见图8）。从青菜头原料中没有鉴定出芽孢杆菌属（Bacillus），然而细菌群落中存在很低丰度的Rhodococcus(0.184 8%）和Staphylococcus(0.026 4%），没有鉴定到种的水平，如表4所示。由此可初步推测，引起变红现象的嗜吡啶红球菌（Rhodococcus pyridinivorans）和引起产膜现象的表皮葡萄球菌（Staphylococcus epidermidis）有可能来源于青菜头原料。