《表2 自同构检测时间:基于对称破坏的子图同构约束求解算法》

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《基于对称破坏的子图同构约束求解算法》


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在PDBSV2数据集中,算法求解平均时间见表1,其对应自同构检测时间见表2。表中参数“解的数量”用于比较在同一问题实例下,本文算法与其它算法求得解的数量。如在Q4规模下,VFSBC求得10 848个解,VF2求得13 696个解,说明其中有2848个解是重复解,在求解时,是不需要被计算的。实验结果显示,VFSBC算法的表现同样优于VF2及ILF算法。在规模为Q16时,本文算法的求解速度是VF2的1.55倍,统计Q4-Q128这6组实验组,其平均求解速度是VF2算法的1.18倍,平均减少1015个重复解。当模式图的规模处于Q32以下时,自同构检测时间依然占比甚微,但是随着模式图的规模增加,自同构检测的时间所占比例逐渐增大。因为自同构检测是一个连续发散的过程,一方面其检测时间受划分内单元数量影响;另一方面,其复杂度随搜索树深度的增加呈指数级增长。如何解决图规模增大带来的自同构检测负担,是需要进一步解决的问题。