《表2 SSR引物名称和序列》
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《基于不结球白菜转录组EST-SSR标记开发及多态性分析》
重复基序括号外数字为其重复次数
利用Primer Premier 3.0对筛选出的SSR位点进行EST-SSR引物批量设计,以不同重复基元类型设计的引物中随机挑选40对(表2),由北京六合华大基因科技有限公司合成。采用CTAB(cetyl-trimethyl-ammol/lonium bromide)法提取DNA(何宇宁,2017)。先用40对引物对92份不结球白菜种质资源中随机10份的DNA混样进行初步筛选,当引物可以获得目的大小的条带时,再分别用92份不结球白菜样品逐个扩增,进行多态性引物的筛选。参考时小东(2016)方法进行PCR扩增,扩增程序为:94℃预变性5 min;94℃变性45 s,退火温度及对应的延伸时间分别为:GS1为58℃90 s,GS2为57℃90 s,共35个循环;72℃延伸10 min,结束后4℃保存。分别利用1.0%琼脂糖凝胶和8.0%非变性聚丙烯酰胺凝胶检测扩增产物。琼脂糖凝胶在凝胶成像仪上观察、拍照并读带。
图表编号 | XD00121701100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.01.25 |
作者 | 杨丹青、何晓丽、杜志杰、王树彬、孙笠维、林义章、邵贵荣、钟凤林 |
绘制单位 | 福建农林大学园艺学院、福建农林大学园艺学院、福建农林大学园艺学院、福建农林大学园艺学院、福建农林大学园艺学院、福建农林大学园艺学院、福建金品农业科技股份有限公司、福建农林大学园艺学院、福建农林大学蔬菜研究所 |
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