《表1 CAZy数据库中CBM67家族统计信息》

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《真核α-L-鼠李糖苷酶的碳水化合物结合结构域功能架构分析》


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CAZy数据库将目前已知的CBM根据氨基酸差异性划分为81个不同的家族,主要根据它们所属的家族和不同的物种来源进行命名[6]。水解酶中一般有1个或者多个CBM,CBM多以串连的方式出现在水解酶中,通常从酶的N端开始命名,例如CBM2-1是第1个CBM,CBM2-2是第2个CBM,以此类推。在当前81个CBM家族中包含95621种CBM,此外还有300余种CBM未进行分类[7-9]。α-L-鼠李糖苷酶来源的CBM被收录在CBM67家族中,其蛋白质序列共计422条。对CBM67家族的序列进行统计(表1),发现其中有1条来自古菌,397条来自细菌,23条来自真核生物,还有1条没有分类;在这其中具有晶体结构的序列2条,具有酶学表征的序列3条。其中真核的23条序列中有11条为重复序列,12条未重复序列有11条来自担子菌亚门,剩余1条来自担子菌门。