《表4 不同物种防御素的来源》

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《紫苏防御素基因的克隆与分析》

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分别从拟南芥数据库和NCBI上下载了拟南芥防御素和其它物种防御素基因（表4），多序列比对（图2）分析发现，PfPDF1、PfPDF2和其它已报道的植物防御素一样，具有一个α-核心基序（α-core motif）和一个γ-核心基序（γ-core motif）。α-核心基序是主要存在于植物防御素中的一个保守基序，其结构为GXC-（X3-5）C，其中G和C分别为保守的甘氨酸和半胱氨酸残基，X代表任意氨基酸残基。γ-核心基序是广泛存在于抗菌肽家族中的保守结构，其结构为GXC（X3-9）C。DISULFIND在线软件对Pf PDF1、Pf PDF2的二硫键预测显示，PfPDF1、PfPDF2和已报道的大多数植物防御素一样，具有典型的Cys1-Cys8，Cys2-Cys5，Cys3-Cys6，Cys4-Cys7的二硫键连接形式，这些二硫键的形成是植物防御素半胱氨酸稳定的αβ构象的基础（Yang et al.，2009）。