《表2 梁山慈竹Df BBM理化性质分析》

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《梁山慈竹BABY BOOM基因的克隆与表达分析》

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对Df BBM蛋白功能结构域分析，发现Df BBM含有AP2结构域，Df BBM，Zm BBM2，AeBBM1和EtBBM的AP2结构域的氨基酸序列比对分析发现都含有2个AP2结构域（图4）。利用MEME[9]在线工具对梁山慈竹、野生稻和水稻基因编码的蛋白序列进行识别分析（图5）。可以看出BBM和Zm BBM2，AeBBM1，EtBBM之间含有8个保守基序，这可能有助于研究Df BBM和其他物种BBM基因的相似功能。蛋白质二级结构预测表明，蛋白以无规则卷曲为主，含有31.15%的α-螺旋，8.2%的β-转角，15.03%的延伸链和45.63%的无规则卷曲。从图6可以看出蛋白质三级结构主要以β转角为主。梁山慈竹BBM基因理化性质如表2所示，Df BBM基因编码的酸性残基多于碱性残基。蛋白的亲疏水性预测结果，推测Df BBM基因编码的蛋白为亲水性蛋白。从图7和图8看出Df BBM氨基酸序列可能存在26个磷酸化丝氨酸位点。Df BBM氨基酸序列可能有1个N型糖基化位点，6个O型糖基化位点。