《表1 生物信息学分析及使用软件》

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《烟草miRNA169基因家族及启动子的生物信息学分析》

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使用DNAMAN6.0和MEGA5.0软件对烟草miRNA169家族前体序列进行比对分析，并将其定位在相应的烟草基因组上。其次，截取pre-miRNA169起始位点上游2 000 bp序列作为预测启动子，利用在线分析软件对潜在的启动子区域及CpG岛[CpG岛是富含CpG（胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤）二核苷酸的一些区域，通常位于基因启动子的核心序列和转录起始点附近]等进行预测。最后，综合运用PlantPAN2.0数据库和PlantCARE数据库对烟草miRNA169启动子进行结构分析，预测可能存在的顺式作用元件。采用的软件见表1。