《表1 去泛素化酶抑制剂:化学拔尖学生培养课程——化学生物学实验课程建设与实践》

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《化学拔尖学生培养课程——化学生物学实验课程建设与实践》


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在“蛋白质连接反应与蛋白质半合成”实验中,学生通过内含肽蛋白自剪切原理获取泛素(Ub)-酰肼蛋白Ub(1-75)-NHNH2,再利用表达蛋白连接技术将生物表达蛋白与化学合成的Glycine-AMC进行连接,从而得到目标蛋白质Ub-AMC。作为检测去泛素化酶(DUB)活性的分子工具,Ub-AMC能够被DUBs水解,产生与DUBs活性相关的荧光信号AMC,从而可以被应用于DUBs抑制剂的高通量筛选[7,8]。现有教材中,学生在完成Ub-AMC底物合成后,会运用泛素羧基端水解酶(UCH)及酶标仪来对所合成产物Ub-AMC的活性进行鉴定[9]。通过查阅相关DUB抑制剂,我们设计加入针对UCH的商品化抑制剂TCID[10],比较在相同抑制剂浓度下,TCID与广谱DUB抑制剂PR619[11]对Ub-AMC的活性影响(表1)。学生利用自己所合成的泛素探针表征DUB抑制剂,可以更好地理解去泛素化酶的工作原理,从而衔接科研进展与实验教学。